ATAC-seq、CUT&Tag联合多组学应用，轻松拿捏表观遗传

ATAC-seq是利用Tn5转座酶切割染色质开放区域并标记DNA序列，结合二代测序来获得相应基因信息。ATAC-seq技术的核心是孵育连接测序接头的Tn5酶。Tn5酶对染色质开放区进行打断，在打断的同时加上测序接头，接着进行DNA提取，PCR扩增构建文库。经过测序，推断染色质可及性、转录因子结合位点、组蛋白修饰区域和核小体位置。 近岸蛋白为助力表观遗传研究，革故鼎新，今年初成功升级ATAC-seq实验方案2.0版本。

图1. ATAC-seq实验方案2.0流程示意图

CUT&Tag技术作为一种新的DNA-蛋白质互作技术，与传统的ChIP-seq技术有着根本不同，以其实验周期短（＜10小时）、步骤简单（无需超声破碎和免疫共沉淀）、细胞起始量低（10万以下，乃至单细胞）、重复性好、信噪比高等优势，成为众多研究人员的选择。2019年近岸蛋白质推出CUT&Tag试剂盒，仅仅一个试剂盒就可以完成从靶蛋白结合DNA片段的获取到测序文库的构建。截止2024年8月底，CUT&Tag试剂盒引用文献超过100篇，越来越多的研究表明，这是一个可以完全替代ChIP-seq的技术。

图2.CUT&Tag与ChIP-Seq对比

对于表观遗传学的研究不能只局限于整个分子网络中的某个局部细节，多维度、全方面研究表型调控机制才是大势所趋。细数表观遗传相关高分文章不难发现，文章不仅仅包括ATAC-seq、RNA-seq、CUT & Tag、ChIP-seq这些常见表观组学研究技术，更会涉及蛋白质组学、代谢组学、脂质组学、微生物组学等。

本文对ATAC-seq、CUT&Tag技术联合组学的发表文章进行分类汇总（见下图），扫描下方二维码，即可获取文献包。（文献包较大，建议电脑下载哦~）

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图3 相关文献整理

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